Was heißt das?

Doch, dein Note 9 S-Pen hat Bluetooth und daher auch einen Akku, die Prozente da sind eben genau der Akkustand von deinem S Pen. Wenn du den Stift aus dem Handy ziehst sucht er automatisch nach einer Verbindung und verbraucht daher Akku.

Die Ladung wird womöglich nicht lange halten da das Note 9 ja auch schon relativ "alt" ist und der Akku daher schon ordentlich Kapazität verloren hat, besonders wenn er über einen langen Zeitraum entweder komplett voll oder leer war.

Das dürfte der Ladestand des eingebauten Kondensators sein.

Hier sind ein paar nähere Informationen zum S-Pen: https://www.smartdroid.de/samsungs-s-pen-hat-neuen-super-akku/

Wie hier schon berichtet wurde, hat der S-Pen keinen Akku, sondern einen Kondensator. Der soll aber beim S-Pen die Aufgabe eines kleinen Akkus übernehmen. Es gibt Stiftfunktionen - und damit meine ich nicht das Schreiben -, die auf etwas Zusatzstrom angewiesen sind wie Bluetooth bspw. Glaube die Air-Commands gehören auch dazu.
Du kannst den Stift auch bspw. als Kameraauslöser nutzen. Dafür braucht er auch etwas Strom.

Die Prozente gehen so schnell runter, weil die Kapazität des Kondensators relativ klein ist. Außerdem spielt wie bei Akkus, glaube ich, das Alter des Kondensators eine Rolle.

Der S-Pen Nutzt Bluetooth wie die PC Maus ! Da die Gesten und die Kamera Auslösung Nicht Funktionieren würde ! Der Strom Verbrauch zum Laden ist Minimal